南京共15条地铁线路，300个站点（含规划），线路分别为地铁S8号线、地铁S2号线、地铁S6号线、地铁1号线、地铁3号线、地铁7号线、地铁S1号线、地铁5号线、地铁S3号线、地铁S4号线、地铁S7号线、地铁10号线、地铁2号线、地铁4号线、地铁S9号线。南京地铁具体营运时间如下：
| 线路 | 首班时间 | 末班时间 | 站点数 | |
|---|---|---|---|---|
| 地铁S8号线 | (长江大桥北-金牛湖) | 05:55 | 22:20 | 19 |
| (金牛湖-长江大桥北) | 06:00 | 22:00 | 19 | |
| 地铁S2号线 | (宁马线)(西善桥-太白) | 06:00 | 22:00 | 16 |
| (宁马线)(太白-西善桥) | 06:00 | 22:00 | 16 | |
| 地铁S6号线 | (宁句线)(句容-马群) | 06:00 | 22:05 | 13 |
| (宁句线)(马群-句容) | 06:00 | 23:00 | 13 | |
| 地铁1号线 | (八卦洲大桥南-中国药科大学) | 05:30 | 23:08 | 32 |
| (中国药科大学-八卦洲大桥南) | 05:47 | 23:27 | 32 | |
| 地铁3号线 | (秣陵-林场) | 05:35 | 23:05 | 31 |
| (林场-秣陵) | 05:50 | 23:00 | 31 | |
| 地铁7号线 | (仙新路-西善桥) | 06:00 | 23:00 | 27 |
| (西善桥-仙新路) | 06:00 | 23:00 | 27 | |
| 地铁S1号线 | (南京南站-空港新城江宁) | 06:00 | 22:40 | 9 |
| (空港新城江宁-南京南站) | 05:57 | 22:40 | 9 | |
| 地铁5号线 | (吉印大道-方家营) | 06:00 | 23:00 | 30 |
| (方家营-吉印大道) | 06:00 | 23:00 | 30 | |
| 地铁S3号线 | (南京南站-高家冲) | 06:00 | 22:00 | 19 |
| (高家冲-南京南站) | 06:00 | 22:00 | 19 | |
| 地铁S4号线 | (宁滁线)(滁州高铁站-南京北站) | 06:30 | 21:30 | 17 |
| (宁滁线)(南京北站-滁州高铁站) | - | - | 17 | |
| 地铁S7号线 | (空港新城江宁-无想山) | 06:00 | 22:00 | 9 |
| (无想山-空港新城江宁) | 06:00 | 22:00 | 9 | |
| 地铁10号线 | (雨山路-东麒路) | 05:40 | 23:00 | 24 |
| (东麒路-雨山路) | 06:00 | 23:15 | 24 | |
| 地铁2号线 | (经天路-鱼嘴) | 06:00 | 23:00 | 30 |
| (鱼嘴-经天路) | 06:00 | 23:00 | 30 | |
| 地铁4号线 | (龙江-仙林湖) | 06:00 | 23:00 | 18 |
| (仙林湖-龙江) | 06:00 | 23:00 | 18 | |
| 地铁S9号线 | (翔宇路南-高淳) | 06:00 | 22:00 | 6 |
| (高淳-翔宇路南) | 06:00 | 22:00 | 6 | |
